Um eine vollständige Reaktion eines Materie-Antimaterie-Gemisches zu erreichen muss die Annihilation vollständig in einem kleinen Zeitfenster ablaufen, bevor die dabei entstehende Energie das Gemisch auseinander treibt. Kommt in diesem Zeitfenster nur ein Teil der Ladung zur Reaktion, so wird der verbliebene Teil durch die Energie auseinander getrieben und verteilt sich dabei. Hierbei kommt es zu weiteren, zufälligen Zusammenstößen von Materie und Antimaterie, welche aber nun zeitlich verteilt und nicht mehr am Ort der Ladung stattfinden. Dessen Wirkung geht dadurch zum Teil oder ganz verloren. Ein gewisser Teil der Ladung kommt meist sogar garnicht zur Reaktion, was allerdings stark von der Bauform abhängig ist.
Die Führung der Annihilation innerhalb des richtigen Zeitfenster ist eine technisch komplizierte Sache und einer der Hauptgründe, warum Antimateriesprengköpfe nicht in unbegrenzter Größe gebaut werden können.