2371
... wird die Avenger auf eine Kartographie- und Erforschungsmission tief in den Alpha-Quadranten geschickt. Die Reise beginnt mit der Durchquerung des Ferengi-Raums. Mit Hilfe eines Wurmloches gerät die Avenger tiefer in den Alphaquadranten und verbringt mehrere Monate in einem gefährlichen roten Nebel, erforscht diesen gründlich und schafft es letzt endlich ihn zu verlassen. Die Avenger kann wieder Kontakt zur Sternenflotte herstellen und wird beauftragt, sofort in den Föderationsraum zurück zukehren, da sich politische Spannungen anbahnen und auf die Präsens eines Schiffes der Sovereign-Klasse nicht verzichtet werden kann.
2372
Noch bevor die Avenger in den Föderationsraum zurückgekehrt ist, greifen die Klingonen Cardassia und Deep Space Nine an. Nach dem Attentat auf die Diplomtische Konferenz zwischen Föderation und den Romulanern, wird die Avenger als Schutz und Abschreckung, zur Erde abgestellt. Der Föderation wird bewusst, dass die Erde nun auch ein potenzielles Ziel darstellt. Während der Stationierung, haben einige Crewmitglieder die Möglichkeit, kurzzeitig andere Aufgabenfelder innerhalb der Föderation zu übernehmen, wie Lt. Darvin, der sich auf ein Lazarettschiff versetzen lässt und dort bis Ende des Krieges stationiert bleibt.
2373
Während des Angriffs der Borg auf die Erde, schließt sich die Avenger der '001'-Flotte an und
versucht, den Borgangriff zu stoppen, was durch den Zeitsprung der Enterprise auch gelingt.
Nach dem Sieg über die Borg und die Bekanntgabe des Beitritts der Cardassianer zum Dominion, wird die Avenger zur diplomatischen Mission in den romulanischen Raum geschickt, um zu verhindern, dass die Romulaner sich ebenfalls dem Dominion anschließen. Nach dem Scheitern dieser Mission, treten die Romulaner, neben den Tholianern, den Miradonen und den Bajoranern einem Nichtangriffspakt mit dem Dominion bei und die Avenger wird unverzüglich nach Sternenbasis 375 befohlen, um bei den bevorstehenden militärischen Auseinandersetzungen zu helfen. Der Angriff des Dominions und der Rückzug von DS9 folgt.
2374
Nach mehreren kleineren Einsätzen, schließen sich die 2te (inkl. Avenger), 5te und 9te Flotte mit einigen klingonischen Kreuzern zusammen, um DS9 zurück zu erobern. Die Nachricht, dass das ausgelegte Minenfeld am Wurmloch innerhalb von 3 Tagen von den Cardassianern beseitigt werden kann, zwingt die 2te und 5te Flotte zum Aufbruch. Die Avenger trägt dazu bei, dass eine Lücke in den Wall der Dominionschiffe gerissen wird und die Defiant nach DS9 vordringen kann. Nach diesem Einsatz werden mehrere Reparaturen auf der Avenger nötig, die bis zum Ende des Jahres durchgeführt werden.
Nach dem Fall von Betazed und dem Beitritt der Romulaner in den Krieg gegen das Dominion, wird eine alliierte Flotte zur Eroberung des Chin'Toka-Systems gebildet. Die USS Avenger, so wie einige ausgewählte Schiffe, ausgestattet mit einem Elite-Boden-Trupp der Sternenflotte, schaffen es, die Dominionschiffe und die Waffenplattform auszuschalten und die Planeten mit Landungstruppen zu besetzen. Die Aufgabe der Avenger ist es, ihre Elite-Einheit auf AR-558 bei der Kommunikationsplattform abzusetzen.
2375
Die Avenger bleibt im Chin'Toka-System, um die Kommunikationsplattform zu beschützen. Nach einem schweren Angriff des Dominions im April 2375, den die Sternenflotte erfolgreich abwehren kann, wird die Avenger schwer beschädigt und ihre Crew stark dezimiert.
Als die Breen sich im September 2375 dem Dominion anschließen, ist das Chin'Toka-System nicht mehr zu halten und die Avenger muss sich zurückziehen.
Trotz der noch nicht ganz abgeschlossenen Reparaturen, lässt es sich die Crew der Avenger nicht nehmen, an der letzten Schlacht bei Cardassia Prime teilzunehmen. Nach dem erfolgreichen Sieg über das Dominion, nimmt die Avenger Kurs auf die im Bajorsektor liegende Antares-Werft, um erneut Reparaturen durchführen zu lassen.